因房屋由建商出資興建，實際上地主係以所持有的土地與建商交換而取得所分配之房屋，應依契稅條例第2條規定，按契價百分之2課徵交換契稅，但按比例分配有不足整戶者，如由地主取得該戶並以價金補貼建商者，該部分應按契價百分之6向地主課徵買賣契稅，而如由建商取得該戶並以價金補貼地主者，該部分應按契價百分之6向建商課徵買賣契稅。
合建分屋的申報期限，房屋如於建造完成後，由建商移轉予地主，應於移轉契約成立之日起30日內申報；如於建造前或建造中變更起造人名義，以地主為起造人並取得使用執照者，應於使用執照核發之日起60日內申報契稅。